| 城 | 所在地 | 築城・創建 | 文化財指定 |
|---|---|---|---|
| 北方城 | 北方町 | — | — |
| 古川城 | 飛騨市 | — | — |
| 城の坂遺跡 | 岐阜県 | — | — |
| 増島城 | 飛騨市 | 1586 | — |
| 墨俣城 | 大垣市 | 1567 | — |
| 大垣城 | 大垣市 | 1535 | — |
| 妻木城 | 土岐市 | — | — |
| 寺林城 | 飛騨市 | — | 日本国指定史跡の構成資産 |
| 小倉山城 | 美濃市 | 1605 | — |
| 山口城 (美濃国) | 美濃国 | — | — |
| 岐阜城 | 岐阜市 | 1201 | 日本国指定史跡 |
| 川手城 | 岐阜市 | 1353 | — |
| 帰雲城 | 白川村 | 1460 | — |
| 広瀬城 | 高山市 | — | — |
| 政元城 | 飛騨市 | — | 日本国指定史跡の構成資産 |
| 明智城 | 可児市 | 1342 | — |
| 明知城 | 恵那市 | 1247 | — |
| 松倉城 | 高山市 | 1579 | — |
| 桜洞城 | 下呂市 | — | — |
| 江馬氏下館 | 飛騨市 | 1400 | 名勝 |
| 池田城 (美濃国) | 岐阜県 | — | — |
| 洞城 | 飛騨市 | — | 日本国指定史跡の構成資産 |
| 浅野館 | 土岐市 | — | — |
| 神岡城 | 飛騨市 | 1564 | — |
| 竹中氏陣屋 | 垂井町 | 1588 | — |
| 篠脇城 | 郡上市 | 1400 | — |
| 苗木城 | 中津川市 | 1532 | 日本国指定史跡 |
| 萩原諏訪城 | 下呂市 | — | — |
| 赤谷山城 | 郡上市 | 1541 | — |
| 郡上八幡城 | 郡上市 | 1559 | — |
| 長森城 | 岐阜市 | 1185 | — |
| 阿寺城 | 中津川市 | — | — |
| 飯羽間城 | 岐阜県 | — | — |
| 馬籠城 | 中津川市 | — | — |
| 高原諏訪城 | 飛騨市 | — | — |
| 高堂城 | 高山市 | — | — |
| 高山城 | 高山市 | 1588 | — |
| 鵜沼城 | 各務原市 | — | — |
| 鷺山城 | 岐阜市 | — | — |